99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1231 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  85.17 
 
 		 209 aa  374  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  84.21 
 
 		 209 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  84.21 
 
 		 209 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  75.61 
 
 		 209 aa  321  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  73.56 
 
 		 209 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  74.63 
 
 		 204 aa  318  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  74.15 
 
 		 209 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  57.89 
 
 		 221 aa  241  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  58.62 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  57.64 
 
 		 215 aa  231  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  53.37 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  51.78 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  44.09 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0986  chaperone protein TorD  36.44 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  38.53 
 
 		 220 aa  124  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  33.65 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  34.12 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  35.55 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  34.65 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.67 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1109  chaperone protein TorD  34.16 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01008  hypothetical protein  34.16 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01001  chaperone protein TorD  34.16 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2644  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.16 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437385  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2597  chaperone protein TorD  34.16 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.382681 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  33.66 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2316  chaperone protein TorD  33.66 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2126  chaperone protein TorD  33.66 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  34.85 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.31 
 
 		 237 aa  91.7  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  35.38 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  34.85 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  34.34 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  34.34 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.7 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  33.59 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.14 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  26.24 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  27.81 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.23 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.73 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.73 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.52 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.73 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.13 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  27.75 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  24.26 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.18 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  28.28 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  32.14 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.16 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.76 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  24.75 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.21 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.7 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  26.37 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.25 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.73 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  23.77 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.13 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.39 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.12 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  26.9 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.82 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  22.44 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.26 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.72 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.14 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.05 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.75 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.14 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.16 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.83 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.87 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.47 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.47 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.58 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.61 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.56 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.78 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  26.47 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.97 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.28 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.18 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.61 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0816  hypothetical protein  23.25 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.88 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.5 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  20.91 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1648  FecI-like sigma-24  26.01 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.02 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  25.74 
 
 		 186 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1068  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.51 
 
 		 178 aa  42  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.685316  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  27.43 
 
 		 186 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  22.16 
 
 		 205 aa  42  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.46 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>