87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3615 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  81.02 
 
 		 225 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  80.56 
 
 		 225 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  80.18 
 
 		 225 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  80.56 
 
 		 225 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  80.56 
 
 		 225 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  78.28 
 
 		 224 aa  362  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  78.7 
 
 		 225 aa  359  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  78.7 
 
 		 225 aa  359  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  78.7 
 
 		 225 aa  359  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  78.44 
 
 		 221 aa  358  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  78.24 
 
 		 225 aa  357  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  77.63 
 
 		 230 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  78.74 
 
 		 231 aa  347  7e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  74.21 
 
 		 221 aa  341  7e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  47.06 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  48.33 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  45.77 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  45.08 
 
 		 223 aa  167  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  45.99 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.99 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.99 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  44.72 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.71 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.71 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  43.16 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  42.33 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.69 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  42.86 
 
 		 260 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.53 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  37.17 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.85 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.64 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.46 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.62 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  36.32 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  38.71 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.86 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.68 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.7 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.7 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  35.98 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  36.76 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.58 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.31 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.44 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.19 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  26.67 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  26.64 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  26.15 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  25.64 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  25.13 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  24.62 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  23.59 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  24.62 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  27.75 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  23.98 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.71 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.74 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  25.25 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  26.32 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0657  DMSO-membrane protein  30.77 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  26.54 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.02 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.72 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  25.84 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  25 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  25.13 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.79 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  23.81 
 
 		 936 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.78 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  23.3 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.87 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.62 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  21.36 
 
 		 218 aa  45.1  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.7 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0360  Putative anaerobic dehydrogenase-like component  27.59 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.72 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  21.27 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.56 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.95 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  24.22 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.98 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  23.58 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.07 
 
 		 228 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  29.41 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>