113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1122 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  100 
 
 		 223 aa  460  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  54.88 
 
 		 208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  51.6 
 
 		 210 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.73 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.73 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.73 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.11 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  49.49 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.23 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.23 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.73 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  46.11 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.16 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.23 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.07 
 
 		 231 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.6 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.92 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  45.08 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.52 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  39.72 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.67 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  40.31 
 
 		 217 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  41.27 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  42.63 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.58 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  40.93 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.38 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  39.25 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  39.02 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.6 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  48.36 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.83 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.73 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.12 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.57 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.57 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  44.96 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.15 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  35.53 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.63 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.5 
 
 		 216 aa  114  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.08 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  34.03 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.8 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.74 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.87 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  25.87 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  24.88 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  27.41 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.89 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  27.55 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  28.06 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  28.06 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  26.4 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  27.69 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  24.38 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.71 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  24.3 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.02 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  26.53 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  26.47 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.5 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  26.45 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.69 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368471 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.45 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.45 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  29.69 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.04 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  26.5 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  27.4 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.35 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.19 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.21 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  27.86 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.69 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  24.34 
 
 		 936 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  28.26 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  27.72 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  20.56 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.34 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  25.81 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.32 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.13 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.97 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0823  hypothetical protein  28.37 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.781807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.17 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.1 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  22.42 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  23.11 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.36 
 
 		 195 aa  48.5  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  29.66 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.82 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0115942  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.91 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0803  hypothetical protein  24.05 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.08 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.82 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.13 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.72 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>