103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003496 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  100 
 
 		 208 aa  428  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  85.71 
 
 		 210 aa  378  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  54.88 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  53.65 
 
 		 203 aa  203  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  52.78 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  52.78 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  51.11 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  51.67 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  51.67 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  51.67 
 
 		 225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  51.67 
 
 		 225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  51.67 
 
 		 225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  51.67 
 
 		 225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  51.11 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  51.11 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  50.56 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  48.21 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.41 
 
 		 224 aa  178  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  48.33 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  44.69 
 
 		 235 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  41.08 
 
 		 260 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.67 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.67 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.3 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.92 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  34.76 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.66 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.48 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  36.13 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  34.36 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  36.99 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  34.38 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  34.02 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.83 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.16 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.93 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.66 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.55 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.55 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.16 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.29 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  31.66 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  31.41 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.46 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.91 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.51 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.27 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.35 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  25.13 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.78 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  24.28 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  24.5 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  26.23 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.65 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.53 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.74 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  23.5 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.71 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  26.23 
 
 		 936 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  24.14 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.2 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  25.59 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.48 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0657  DMSO-membrane protein  24.06 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.53 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.53 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.27 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.87 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  24.29 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.06 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  25.53 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  26.06 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.66 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.01 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.58 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1686  hypothetical protein  26.67 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  27.98 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.53 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  27.98 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.98 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.63 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.27 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.36 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1506  hypothetical protein  26.67 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  24.5 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.83 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1866  hypothetical protein  26.67 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1935  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.51 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161527  hitchhiker  0.00430197 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.9 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  26.09 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.46 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.42 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.59 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.26 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.17 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.8 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.43 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.26 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.35 
 
 		 250 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.95 
 
 		 221 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>