95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0055 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
221 aa  455  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  79.72 
 
 
225 aa  353  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  80.19 
 
 
225 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  80.19 
 
 
225 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  80.19 
 
 
225 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  79.72 
 
 
225 aa  351  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  77.88 
 
 
225 aa  351  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  75.56 
 
 
225 aa  348  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  75.11 
 
 
225 aa  347  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  75.11 
 
 
225 aa  346  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  79.23 
 
 
224 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  74.21 
 
 
221 aa  341  7e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  79.23 
 
 
230 aa  340  8e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  79.71 
 
 
231 aa  340  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  78.26 
 
 
221 aa  337  8e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  51.34 
 
 
210 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  48.26 
 
 
203 aa  188  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  50.56 
 
 
208 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  46.11 
 
 
223 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  47.06 
 
 
235 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.85 
 
 
211 aa  148  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.85 
 
 
211 aa  148  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  43.39 
 
 
210 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  42.63 
 
 
217 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.34 
 
 
220 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  40.48 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.39 
 
 
211 aa  131  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.2 
 
 
223 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.2 
 
 
223 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  36.82 
 
 
208 aa  128  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.36 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  40.86 
 
 
260 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  39.15 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.3 
 
 
212 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.62 
 
 
200 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.3 
 
 
212 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.68 
 
 
205 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  38.71 
 
 
208 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  38.95 
 
 
207 aa  118  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.79 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.27 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.22 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  34.2 
 
 
222 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.34 
 
 
214 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.69 
 
 
216 aa  98.6  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.31 
 
 
204 aa  98.2  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.24 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  26.11 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  26.11 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  26.15 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  25.64 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  25.64 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  25.64 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  23.3 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  23.35 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  27.03 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  26.73 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  25 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  26.13 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  25.62 
 
 
936 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  23.18 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  24.88 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  24.88 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.09 
 
 
239 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.99 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.08 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  24.64 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.47 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  24.76 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.86 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  25.26 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.44 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  24.75 
 
 
231 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.95 
 
 
241 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.72 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  23 
 
 
226 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  21.7 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  28.89 
 
 
224 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24 
 
 
285 aa  45.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.11 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  24.81 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.76 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.79 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  21.79 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  22.61 
 
 
244 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  19.53 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.46 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.5 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  20.95 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.41 
 
 
219 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.18 
 
 
204 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.78 
 
 
211 aa  42  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  20.98 
 
 
250 aa  42  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.41 
 
 
219 aa  41.6  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>