129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2816 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 		 241 aa  495  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  51.56 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  51.77 
 
 		 219 aa  238  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  52.02 
 
 		 219 aa  234  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  48.44 
 
 		 219 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.79 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.11 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.04 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.59 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.71 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  40.44 
 
 		 221 aa  184  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.99 
 
 		 221 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  33.16 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.74 
 
 		 206 aa  98.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3864  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.69 
 
 		 206 aa  93.2  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0799961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.7 
 
 		 206 aa  89.7  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0328008  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.47 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.29 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.57 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  26.77 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.93 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  31.55 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.35 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.17 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.88 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.16 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.72 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.28 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.75 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.21 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.19 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.78 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  26.88 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.77 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  30.77 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.77 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.77 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.77 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.77 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  30.77 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.77 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.46 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.07 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  28.3 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.29 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.29 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.29 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.29 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.29 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.77 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.68 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  33.09 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  28.82 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.69 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.65 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.16 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.86 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  26.15 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  25.69 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.69 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06850  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.35 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224601 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.28 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  26.06 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  24.26 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.38 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.06 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  25.17 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.06 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.71 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.33 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  27.42 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.35 
 
 		 186 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.91 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.24 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.01 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  26.11 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.06 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.06 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  27.67 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.5 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  25.36 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.26 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  25.83 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  24.82 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.21 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  26.25 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  25.83 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  27.17 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  27.69 
 
 		 936 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.42 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.53 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  25.47 
 
 		 217 aa  48.9  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.11 
 
 		 204 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  22.77 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  25 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4213  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.36 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0657  DMSO-membrane protein  29.08 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  24.29 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.95 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>