51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1399 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 		 216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  45.6 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  46.11 
 
 		 208 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43 
 
 		 212 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43 
 
 		 212 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  42.86 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  42.29 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.05 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.35 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.35 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  41.54 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  41.38 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.05 
 
 		 204 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.31 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  37.89 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  36.46 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.54 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  38.5 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  32.29 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  30.21 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  36.32 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.51 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.84 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.77 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.69 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.69 
 
 		 230 aa  95.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  31.44 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.51 
 
 		 200 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.69 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.32 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.8 
 
 		 201 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  29.17 
 
 		 225 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  34.38 
 
 		 222 aa  91.3  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.5 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  35.71 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.83 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.09 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  24.37 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.74 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.84 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>