74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2184 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  77.4 
 
 		 200 aa  287  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1935  cytoplasmic chaperone TorD family protein  68.98 
 
 		 195 aa  274  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161527  hitchhiker  0.00430197 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1799  cytoplasmic chaperone TorD family protein  71.43 
 
 		 192 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2076  cytoplasmic chaperone TorD family protein  69.27 
 
 		 190 aa  261  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  70.88 
 
 		 186 aa  260  6.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  70.88 
 
 		 186 aa  260  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  70.88 
 
 		 186 aa  260  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2053  chaperone, TorD family  64.67 
 
 		 184 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.110263  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1233  TorD family chaperone  64.67 
 
 		 184 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1248  chaperone, TorD family  64.67 
 
 		 184 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2236  chaperone, TorD family  64.67 
 
 		 184 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.68342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1203  chaperone, TorD family  64.13 
 
 		 184 aa  244  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  63.59 
 
 		 184 aa  243  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  63.59 
 
 		 184 aa  243  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1413  chaperone, TorD family  63.04 
 
 		 184 aa  240  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01039  hypothetical protein  63.04 
 
 		 184 aa  240  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1153  chaperone TorD  63.04 
 
 		 184 aa  240  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2294  chaperone, TorD family  63.04 
 
 		 184 aa  240  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.250336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1154  chaperone TorD  63.04 
 
 		 184 aa  240  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01032  hypothetical protein  63.04 
 
 		 184 aa  240  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  64.94 
 
 		 184 aa  237  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1551  cytoplasmic chaperone TorD family protein  60.33 
 
 		 184 aa  236  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143271  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0574  oxidoreductase component  41.4 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  30.69 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.69 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.69 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  30.69 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.69 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.69 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.69 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.69 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  36.36 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.16 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.11 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.75 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.75 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.22 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.22 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.22 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.36 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.95 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.36 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.32 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.32 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.57 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.83 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.35 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  27.89 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.93 
 
 		 219 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.58 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  32.8 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.59 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.19 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  32.26 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.84 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  27.17 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.68 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  24.74 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.45 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.67 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.29 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.96 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  26.52 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  28.9 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.91 
 
 		 219 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  26.74 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.88 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.07 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  26.23 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  26.9 
 
 		 207 aa  42  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1838  hypothetical protein  27.78 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2181  sulfur reductase  27.78 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.489314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>