39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0574 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0574  oxidoreductase component  100 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.4 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1935  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.71 
 
 		 195 aa  134  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161527  hitchhiker  0.00430197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.48 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  43.48 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  43.48 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1799  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.01 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2076  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.66 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370071  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1551  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.96 
 
 		 184 aa  124  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143271  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.5 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.5 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1154  chaperone TorD  37.63 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01039  hypothetical protein  37.63 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1153  chaperone TorD  37.63 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1413  chaperone, TorD family  37.63 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01032  hypothetical protein  37.63 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2294  chaperone, TorD family  37.63 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.250336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1233  TorD family chaperone  35.29 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2236  chaperone, TorD family  35.29 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.68342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2053  chaperone, TorD family  35.29 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.110263  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1248  chaperone, TorD family  35.29 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1203  chaperone, TorD family  34.76 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  35.96 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.91 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.56 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  26.04 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.04 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  26.04 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.04 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.04 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.04 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.04 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.04 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.31 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.08 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.24 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.6 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  21.84 
 
 		 236 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  21.84 
 
 		 226 aa  41.2  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>