122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1609 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  100 
 
 
204 aa  411  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  97.06 
 
 
204 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  97.06 
 
 
204 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  97.06 
 
 
204 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  97.06 
 
 
204 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  97.06 
 
 
204 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  97.06 
 
 
204 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  96.57 
 
 
204 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  96.08 
 
 
204 aa  394  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  79.9 
 
 
204 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  79.41 
 
 
204 aa  315  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  78.92 
 
 
204 aa  314  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  78.92 
 
 
204 aa  314  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  78.92 
 
 
204 aa  314  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  63.24 
 
 
204 aa  274  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  46.95 
 
 
236 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  45.98 
 
 
226 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  45.79 
 
 
205 aa  181  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  45.54 
 
 
236 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.23 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.58 
 
 
204 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  37.25 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.36 
 
 
217 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.11 
 
 
219 aa  121  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  34 
 
 
203 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.08 
 
 
198 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  34.55 
 
 
224 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  34.55 
 
 
221 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  32.16 
 
 
212 aa  100  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.24 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06850  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  33.33 
 
 
235 aa  97.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  32.46 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.82 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.9 
 
 
221 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.43 
 
 
237 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.37 
 
 
218 aa  89  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  31.05 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.52 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.21 
 
 
219 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1935  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.16 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161527  hitchhiker  0.00430197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  30.33 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  29.44 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.44 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.38 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.44 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1413  chaperone, TorD family  30.39 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.16 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  32.24 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  32.24 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.24 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01032  hypothetical protein  29.83 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01039  hypothetical protein  29.83 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1153  chaperone TorD  29.83 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1154  chaperone TorD  29.83 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2294  chaperone, TorD family  29.83 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.250336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.45 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.38 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1233  TorD family chaperone  28.89 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1248  chaperone, TorD family  28.89 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2053  chaperone, TorD family  28.89 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.110263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2236  chaperone, TorD family  28.89 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.68342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1551  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143271  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1203  chaperone, TorD family  28.33 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.19 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3864  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.82 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0799961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.79 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.59 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  35.71 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  30.69 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  30.69 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.59 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  30.69 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  30.69 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.7 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0328008  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.77 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  30.69 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.77 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.53 
 
 
221 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1799  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.93 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2076  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.51 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.07 
 
 
241 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  30.95 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.23 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.03 
 
 
284 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.8 
 
 
219 aa  58.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  29.13 
 
 
216 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.91 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.2 
 
 
214 aa  55.5  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0930  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.38 
 
 
240 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.542381 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.53 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.64 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0574  oxidoreductase component  26.04 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.37 
 
 
234 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.82 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.56 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.14 
 
 
285 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.55 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.63 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>