90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2564 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
184 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
184 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01032  hypothetical protein  98.91 
 
 
184 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1153  chaperone TorD  98.91 
 
 
184 aa  370  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1154  chaperone TorD  98.91 
 
 
184 aa  370  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  98.91 
 
 
184 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2294  chaperone, TorD family  98.91 
 
 
184 aa  370  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.250336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1413  chaperone, TorD family  99.46 
 
 
184 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01039  hypothetical protein  98.91 
 
 
184 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1203  chaperone, TorD family  86.96 
 
 
184 aa  338  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2236  chaperone, TorD family  86.41 
 
 
184 aa  337  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.68342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2053  chaperone, TorD family  86.41 
 
 
184 aa  337  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.110263  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1248  chaperone, TorD family  86.41 
 
 
184 aa  337  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1233  TorD family chaperone  86.41 
 
 
184 aa  337  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1551  cytoplasmic chaperone TorD family protein  85.87 
 
 
184 aa  336  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143271  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1935  cytoplasmic chaperone TorD family protein  69.52 
 
 
195 aa  283  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161527  hitchhiker  0.00430197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  65.93 
 
 
186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  65.93 
 
 
186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  65.93 
 
 
186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  63.59 
 
 
189 aa  243  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1799  cytoplasmic chaperone TorD family protein  63.22 
 
 
192 aa  231  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2076  cytoplasmic chaperone TorD family protein  60.67 
 
 
190 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  61.24 
 
 
200 aa  223  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0574  oxidoreductase component  37.5 
 
 
182 aa  122  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  30.56 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.56 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.56 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.56 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  30.56 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.56 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.56 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.56 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.44 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.78 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.69 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.19 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.77 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.49 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.61 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.42 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.93 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.93 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.93 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.09 
 
 
236 aa  61.6  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  28.42 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.6 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.86 
 
 
204 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.57 
 
 
236 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.22 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.41 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  30.25 
 
 
221 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  25.26 
 
 
221 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.32 
 
 
221 aa  55.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  27.66 
 
 
224 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.63 
 
 
198 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.71 
 
 
219 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23 
 
 
221 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  24.6 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.21 
 
 
237 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.56 
 
 
219 aa  51.6  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.83 
 
 
201 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  24.86 
 
 
203 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1866  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.82 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0320246 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  21.76 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  28.33 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  28.33 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  27.74 
 
 
186 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  28.33 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  28.33 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  25.39 
 
 
215 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.47 
 
 
195 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.27 
 
 
218 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.4 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  25.41 
 
 
223 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.09 
 
 
217 aa  45.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0530  hypothetical protein  22.96 
 
 
182 aa  45.1  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.280074  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.67 
 
 
211 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.14 
 
 
204 aa  44.3  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.29 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.67 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.06 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2547  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.62 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0265649  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  26.36 
 
 
222 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  23.91 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.08 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.71 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.55 
 
 
219 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1838  hypothetical protein  27.55 
 
 
166 aa  41.2  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  26.47 
 
 
260 aa  41.2  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  25 
 
 
208 aa  40.8  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>