110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1054 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  95.69 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  95.22 
 
 		 209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  85.17 
 
 		 217 aa  374  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  78.26 
 
 		 209 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  76.92 
 
 		 209 aa  331  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  77.29 
 
 		 204 aa  330  9e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  76.33 
 
 		 209 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  60.29 
 
 		 221 aa  247  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  59.51 
 
 		 223 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  59.11 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  55.34 
 
 		 218 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  53.81 
 
 		 211 aa  194  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  45.91 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0986  chaperone protein TorD  36.89 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  35.75 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  37.56 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  36.14 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01001  chaperone protein TorD  36.14 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2644  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.14 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1109  chaperone protein TorD  36.14 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01008  hypothetical protein  36.14 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  35.64 
 
 		 199 aa  111  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2597  chaperone protein TorD  36.14 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.382681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  35.27 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2126  chaperone protein TorD  35.64 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2316  chaperone protein TorD  35.64 
 
 		 199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  35.27 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.67 
 
 		 221 aa  104  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  35.86 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  36.41 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  35.86 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  35.35 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  35.35 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.82 
 
 		 237 aa  94.7  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.86 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.22 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  25.87 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  31.25 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  28.67 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  25.74 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  28.57 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  28.57 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.59 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.04 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.71 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  30.23 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.6 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.15 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  27.86 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  27.86 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  25.99 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.74 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.85 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.74 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.74 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.88 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.57 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.88 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  26.43 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  24.75 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.25 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  25.12 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.83 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  27.15 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  23.42 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.27 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.57 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.26 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.74 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.83 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.75 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.81 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  21.65 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.49 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.47 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.48 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.33 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.7 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.48 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.35 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.26 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  25.13 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  30.36 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.83 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1750  cytoplasmic chaperone TorD  24.49 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.23 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.15 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  23.71 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.39 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.29 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.02 
 
 		 219 aa  45.1  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.23 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.74 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.05 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.23 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.87 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.91 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  25.23 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02390  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>