59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2126 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2126  chaperone protein TorD  100 
 
 		 199 aa  406  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2644  cytoplasmic chaperone TorD family protein  97.49 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437385  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2597  chaperone protein TorD  96.48 
 
 		 199 aa  393  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.382681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01001  chaperone protein TorD  96.48 
 
 		 199 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01008  hypothetical protein  96.48 
 
 		 199 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1109  chaperone protein TorD  96.48 
 
 		 199 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2316  chaperone protein TorD  95.98 
 
 		 199 aa  390  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  95.48 
 
 		 199 aa  388  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  94.47 
 
 		 199 aa  384  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  65.46 
 
 		 210 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  64.95 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  65.28 
 
 		 210 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  64.43 
 
 		 210 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  64.43 
 
 		 210 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  36.55 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  39 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  34.83 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  34.8 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  35.64 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  36.14 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  35.15 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.06 
 
 		 237 aa  101  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  32.34 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  33.5 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  33.5 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  33.5 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  33.66 
 
 		 217 aa  97.8  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.2 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  34.62 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  32.99 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  32.99 
 
 		 223 aa  94.7  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  33.5 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.5 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  33.67 
 
 		 193 aa  88.2  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  26.41 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  32.98 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0986  chaperone protein TorD  31.63 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  33.49 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  25.91 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.64 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  25.13 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0657  DMSO-membrane protein  32.14 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1750  cytoplasmic chaperone TorD  27.98 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.7 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.87 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.85 
 
 		 229 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  30.09 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.6 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  28.8 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  28 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1563  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.96 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.548826  normal  0.822991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  27.2 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  27.2 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  28.8 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  24.19 
 
 		 236 aa  45.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.73 
 
 		 221 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.53 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.34 
 
 		 238 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.38 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>