69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4104 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  100 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  100 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  99.05 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  98.57 
 
 		 210 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  98.57 
 
 		 210 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  63.4 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2126  chaperone protein TorD  64.43 
 
 		 199 aa  245  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2644  cytoplasmic chaperone TorD family protein  63.4 
 
 		 199 aa  244  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437385  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01008  hypothetical protein  63.92 
 
 		 199 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01001  chaperone protein TorD  63.92 
 
 		 199 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  63.92 
 
 		 199 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1109  chaperone protein TorD  63.92 
 
 		 199 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2316  chaperone protein TorD  63.92 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2597  chaperone protein TorD  63.4 
 
 		 199 aa  242  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.382681 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  38.94 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  37.25 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  37.13 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  36.27 
 
 		 215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  31.08 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  35.47 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  35.35 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  35.35 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.51 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  34.85 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  34.34 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.15 
 
 		 237 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  34.87 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  34.87 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  34.87 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  34.36 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  33.5 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  31.5 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  31.5 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  32.99 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  33.68 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0986  chaperone protein TorD  32.43 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.27 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  35.68 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0657  DMSO-membrane protein  32.63 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  28.16 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  26.18 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.45 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1750  cytoplasmic chaperone TorD  29.74 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.29 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.56 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.01 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.37 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.51 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.87 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  29.75 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  29.75 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  29.75 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.4 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.3 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.3 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.3 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.3 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  29.63 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.32 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.76 
 
 		 214 aa  45.1  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.11 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.52 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  25.27 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  28.93 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  28.93 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.13 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.16 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>