38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02390 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02390  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2380  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.25 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.434719 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000683605 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.59 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2368  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.84 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal  0.379865 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4222  hypothetical protein  31.08 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173102  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22270  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  34.12 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.17 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.08 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1866  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.76 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2045  hypothetical protein  26.18 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.362778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.06 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.58 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.79 
 
 		 229 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.48 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2402  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.48 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3049  hypothetical protein  26.82 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.729916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2354  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.16 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.41 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.93 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  25 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  25 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1750  cytoplasmic chaperone TorD  33.06 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.72 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.68 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2402  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.21 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.54828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  27.03 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368471 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1982  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.89 
 
 		 181 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.334911  hitchhiker  0.00497419 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  26.23 
 
 		 216 aa  42  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  28.18 
 
 		 224 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.3 
 
 		 238 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  28 
 
 		 236 aa  42  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1068  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.89 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.685316  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.72 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>