93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1609 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 		 284 aa  565  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  33.94 
 
 		 226 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.65 
 
 		 225 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.57 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  31.33 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.04 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  30.65 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.92 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.43 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.48 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.97 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.06 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.57 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3661  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.11 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  42.68 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.59 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.11 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2471  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.3 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.71 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.44 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.26 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  43.06 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  43.06 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  43.06 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  43.06 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  43.06 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0130846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  43.06 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.06 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.9 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  43.06 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.3 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22270  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.88 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.57 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.62 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  41.67 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  30.99 
 
 		 203 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.16 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.37 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  44.64 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.15 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.1 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  44.64 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  44.64 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  44.64 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  44.64 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.97 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  36.96 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 		 196 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.4 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.14 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.88 
 
 		 236 aa  53.5  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2547  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.94 
 
 		 199 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0265649  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  40.91 
 
 		 236 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  40.91 
 
 		 226 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 218 aa  52.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.83 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  27.46 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.87 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  26.75 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0360  Putative anaerobic dehydrogenase-like component  25.98 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.45 
 
 		 244 aa  49.7  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0930  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.11 
 
 		 240 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.542381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.11 
 
 		 213 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4213  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.91 
 
 		 195 aa  48.9  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1563  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.69 
 
 		 226 aa  48.9  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.548826  normal  0.822991 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.58 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.27 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.57 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1338  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.84 
 
 		 193 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  24.16 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.28 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.15 
 
 		 190 aa  46.6  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2402  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.71 
 
 		 213 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.54828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  28.28 
 
 		 203 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  26.19 
 
 		 215 aa  46.2  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.62 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  39.06 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.45 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.33 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  40.32 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  35.62 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.71 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.32 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2581  hypothetical protein  29.09 
 
 		 237 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.173611  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.94 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06850  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.77 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.11 
 
 		 221 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2368  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.39 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal  0.379865 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.57 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.67 
 
 		 219 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2243  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.71 
 
 		 189 aa  42.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>