56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00630 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00630  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  100 
 
 
116 aa  239  9e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  40 
 
 
225 aa  87.8  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.73 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.28 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.54 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.45 
 
 
285 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.79 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  31.82 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  30.77 
 
 
226 aa  62  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.91 
 
 
244 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27270  hypothetical protein  29.46 
 
 
284 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  31.58 
 
 
216 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.57 
 
 
239 aa  57.4  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.73 
 
 
225 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.52 
 
 
250 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  32.35 
 
 
230 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.97 
 
 
225 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  32.97 
 
 
231 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.06 
 
 
226 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27590  hypothetical protein  29.81 
 
 
270 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.945374  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.09 
 
 
219 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.89 
 
 
252 aa  52.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  27.68 
 
 
236 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1182  hypothetical protein  32 
 
 
214 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.28 
 
 
214 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  32.29 
 
 
220 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  22.41 
 
 
186 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.43 
 
 
219 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.91 
 
 
212 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  22.41 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  22.41 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.19 
 
 
229 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.18 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.32 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  36.71 
 
 
270 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  22.41 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  23.36 
 
 
186 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0512  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase-like protein  32 
 
 
313 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.17 
 
 
213 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  24.14 
 
 
215 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.36 
 
 
238 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1068  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.43 
 
 
178 aa  45.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.685316  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1982  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.43 
 
 
181 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.334911  hitchhiker  0.00497419 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1494  hypothetical protein  26.92 
 
 
205 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.91 
 
 
222 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.89 
 
 
211 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1563  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.09 
 
 
226 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.548826  normal  0.822991 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  31.58 
 
 
215 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.55 
 
 
217 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.67 
 
 
205 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4213  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.23 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  30.26 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 
234 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.42 
 
 
229 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  27.52 
 
 
936 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2243  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.4 
 
 
189 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>