17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1144 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1144  DMSO-membrane protein  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  32.97 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.63 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  37.63 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1750  cytoplasmic chaperone TorD  31.82 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  33.8 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  20.5 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  23 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0657  DMSO-membrane protein  30.53 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  24.12 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  27.8 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  27.59 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  23.86 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  34.48 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.73 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  27.36 
 
 		 218 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  22.7 
 
 		 209 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>