17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0212 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0212  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.107215  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0537  hypothetical protein  45.79 
 
 
238 aa  150  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.112899  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0753  hypothetical protein  44.97 
 
 
237 aa  149  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1544  hypothetical protein  44.57 
 
 
225 aa  144  6e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0356  hypothetical protein  39.67 
 
 
226 aa  130  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2077  hypothetical protein  32.46 
 
 
236 aa  94.7  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0803  hypothetical protein  31.41 
 
 
247 aa  87.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1866  hypothetical protein  32.04 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1686  hypothetical protein  31.52 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1506  hypothetical protein  31.52 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0205  hypothetical protein  29.79 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0823  hypothetical protein  30.93 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.781807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.15 
 
 
223 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.15 
 
 
223 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  25 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  25.23 
 
 
217 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.73 
 
 
205 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>