105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1507 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  167  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  84.42 
 
 		 81 aa  140  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  57.33 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  53.42 
 
 		 81 aa  91.3  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  52.7 
 
 		 76 aa  86.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  48 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  46.67 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  46.67 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  48.65 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  44.16 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  45.21 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  45.21 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  45.21 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  45.21 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  44 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  41.18 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  43.4 
 
 		 248 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  38 
 
 		 71 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  35.85 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  44.9 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  37.29 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  38 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  30.16 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  36 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.17 
 
 		 250 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  36.73 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  36.73 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  39.58 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  40.38 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  38.3 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  45.1 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  36.73 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  34 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  34 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  40.82 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  38.6 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  38.18 
 
 		 303 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  41.18 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  41.18 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  35.09 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  37.93 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  37.04 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  43.48 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  36.73 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  38.18 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  41.51 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  34.09 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  48.57 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  34.85 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  37.74 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  38.46 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  34.09 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  45.28 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  39.62 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  35.48 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  45.45 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  44 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  34.09 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  34.55 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  31.37 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  35.19 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  44.19 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  29.82 
 
 		 267 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  45.71 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  35.19 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  45.71 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  39.13 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  35.85 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  35.85 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  42.11 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  40.91 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  39.62 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  42.11 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  51.52 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  36.54 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  32.65 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  51.52 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  41.86 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  38.64 
 
 		 159 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  36 
 
 		 64 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  39.53 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  39.53 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  40.82 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  36.96 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  39.62 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  39.53 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  39.53 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  29.85 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  36.73 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  39.13 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  39.13 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  32.73 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  38.64 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>