68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1941 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  357  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  95.91 
 
 		 172 aa  345  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  93.51 
 
 		 155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  91.56 
 
 		 155 aa  295  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  77.98 
 
 		 169 aa  276  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  82.47 
 
 		 158 aa  271  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  80.77 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  79.49 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  80.13 
 
 		 155 aa  258  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  80.13 
 
 		 155 aa  258  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23480  hypothetical protein  76.62 
 
 		 158 aa  249  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  47.52 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  37.93 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  52.17 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  54.35 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  41.67 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  32.26 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  51.11 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  47.83 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  52.27 
 
 		 67 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  52.27 
 
 		 67 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  52.27 
 
 		 67 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  52.27 
 
 		 67 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  52.27 
 
 		 67 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  38.78 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  45.45 
 
 		 83 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  39.22 
 
 		 136 aa  51.6  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  38.98 
 
 		 89 aa  51.2  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  47.73 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  46.51 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  36.54 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  50.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  47.73 
 
 		 86 aa  50.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  47.73 
 
 		 86 aa  50.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  46.67 
 
 		 91 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  47.73 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  47.73 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  38.3 
 
 		 82 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  45.45 
 
 		 87 aa  48.5  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.5 
 
 		 250 aa  48.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  35.19 
 
 		 71 aa  47.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  43.18 
 
 		 80 aa  47.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  46.81 
 
 		 70 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  33.33 
 
 		 58 aa  44.3  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  32.69 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  38.3 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  28.36 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  32.69 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  34 
 
 		 79 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  32.65 
 
 		 94 aa  42  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  28.57 
 
 		 79 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  37.25 
 
 		 72 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  34.69 
 
 		 66 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  33.33 
 
 		 63 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  38.57 
 
 		 121 aa  40.8  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  38.57 
 
 		 121 aa  40.8  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  39.13 
 
 		 82 aa  40.8  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>