122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1179 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  156  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  70.83 
 
 		 77 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  69.44 
 
 		 77 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  69.44 
 
 		 77 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  68.92 
 
 		 83 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  62.16 
 
 		 77 aa  100  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  64.38 
 
 		 75 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  62.5 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  60.81 
 
 		 74 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  58.44 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  60.81 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  63.38 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  63.38 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  63.38 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  63.38 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  52.7 
 
 		 82 aa  86.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.1 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  42.31 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  43.14 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  40.82 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  39.62 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  39.44 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  47.17 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  33.33 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  34.62 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  41.67 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  36.54 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  42.55 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  32.73 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  43.14 
 
 		 55 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  33.96 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  35.85 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  41.51 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  44.9 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  43.75 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  38.89 
 
 		 267 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  38.89 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  48.98 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  42.37 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  38.3 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  46.94 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  38 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  41.67 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  41.18 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  45.28 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  41.46 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  37.25 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  42.31 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  41.51 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  37.04 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  41.46 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  38 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  41.46 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  37.25 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  38.89 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.74 
 
 		 250 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  40 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  33.85 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  37.74 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  38.98 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  41.46 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  34.85 
 
 		 285 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  35.29 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  38.89 
 
 		 248 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  41.51 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  36.84 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  41.51 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  36.21 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  36.21 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  35.29 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  36.21 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  34.72 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  39.22 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  40.74 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  40.91 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  43.14 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  29.11 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  40.43 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  36.73 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  42 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  42 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  37.1 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  39.53 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  42 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  37.29 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  37.29 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  38 
 
 		 303 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  33.96 
 
 		 86 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  42 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  42 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  36.54 
 
 		 88 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  37.31 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  39.53 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  38.1 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>