77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03215 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  100 
 
 		 88 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  50.56 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  50.56 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  58.46 
 
 		 106 aa  91.3  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  50.56 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  49.44 
 
 		 101 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  48.31 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  47.19 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  51.25 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  51.25 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  49.37 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  49.37 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  49.37 
 
 		 106 aa  84.3  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  51.25 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  48.75 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  46.99 
 
 		 121 aa  84.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  61.11 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  45.57 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  47.37 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  45.98 
 
 		 119 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  43.68 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  43.04 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  43.04 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  43.04 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  43.04 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  43.75 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  43.04 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  40.85 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  42.67 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  37.97 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  43.04 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  37.97 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  44.71 
 
 		 88 aa  67  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  43.94 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  42.42 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  53.49 
 
 		 248 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  44.23 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  44.23 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  42.86 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  41.18 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  44.23 
 
 		 52 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  50 
 
 		 285 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  42.31 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  38.98 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  32.31 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  35.85 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.18 
 
 		 250 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  34.85 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  29.63 
 
 		 267 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  43.14 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  45.1 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  41.82 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  37.29 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  43.14 
 
 		 59 aa  42.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  38.18 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  46.67 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  35.29 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  45.24 
 
 		 82 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  44.68 
 
 		 81 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  36.54 
 
 		 76 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  40.91 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  45.24 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  39.13 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  38.78 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  42.37 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  38.78 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  40.91 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  40.43 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  36 
 
 		 75 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>