107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1874 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  249  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  249  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  84.81 
 
 		 79 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  68.48 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  73.42 
 
 		 79 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  73.42 
 
 		 79 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  73.42 
 
 		 79 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  73.42 
 
 		 79 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  69.62 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  58.23 
 
 		 79 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  56.96 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  70.91 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  69.09 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  69.09 
 
 		 102 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  66.67 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  67.27 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  65.45 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  66.13 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  64.52 
 
 		 101 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  63.64 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  62.9 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  62.9 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  62.9 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  59.38 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  62.07 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  49.37 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  56.25 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  45.68 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  48.61 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2562  hypothetical protein  100 
 
 		 38 aa  79.3  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  63.27 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  51.72 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  44.87 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  47.69 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  56.86 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  47.14 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  45.71 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  44.44 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1548  hypothetical protein  65.31 
 
 		 50 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1535  hypothetical protein  65.31 
 
 		 50 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0662033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1736  hypothetical protein  65.31 
 
 		 50 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.122671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1905  hypothetical protein  65.31 
 
 		 50 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1608  hypothetical protein  65.31 
 
 		 50 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  36.99 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  41.82 
 
 		 248 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  43.75 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  41.18 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.07 
 
 		 250 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  51.16 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  42 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  53.49 
 
 		 52 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  43.18 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  40 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  44 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  37.68 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  41.86 
 
 		 285 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  41.67 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  34.18 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  39.58 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  39.22 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  43.64 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  32.91 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  39.62 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  48.84 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  40.91 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  38.98 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  38.89 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  39.58 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  39.58 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  41.86 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  41.86 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  35.48 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  42.59 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  37.29 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  46.51 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  44.19 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  38.57 
 
 		 172 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  35.42 
 
 		 74 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  44.19 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  40.38 
 
 		 80 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 57 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  35.48 
 
 		 67 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  36.73 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  39.66 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  43.18 
 
 		 303 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  39.53 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  39.58 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  38.57 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  35.59 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  36.36 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  44.44 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>