122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0894 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  186  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  74.44 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  78.82 
 
 		 103 aa  143  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  77.65 
 
 		 102 aa  141  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  77.65 
 
 		 102 aa  141  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  76.74 
 
 		 103 aa  140  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  72.22 
 
 		 101 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  74.42 
 
 		 102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  71.11 
 
 		 101 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  75.29 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  70 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  70 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  70 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  63.95 
 
 		 104 aa  124  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  62.22 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  56.63 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  61.9 
 
 		 82 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  67.47 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  56.96 
 
 		 88 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  60.81 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  66.13 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  66.13 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  58.11 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  58.11 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  58.11 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  58.11 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  69.09 
 
 		 79 aa  92  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  58.11 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  62.07 
 
 		 79 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  62.07 
 
 		 79 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  51.25 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  44.44 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  56.86 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  52.54 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  44.71 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  59.46 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  41.38 
 
 		 79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.22 
 
 		 250 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  45.76 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  48.84 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  48.84 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  48.84 
 
 		 52 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  41.86 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  41.86 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  39.44 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  44.9 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1736  hypothetical protein  62.5 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.122671  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  38.71 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  42.22 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  35.29 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1905  hypothetical protein  62.5 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1535  hypothetical protein  62.5 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0662033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  36.54 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  42.22 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1548  hypothetical protein  62.5 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  44.19 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  37.04 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1608  hypothetical protein  59.38 
 
 		 50 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  38.46 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  35.71 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  35.85 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  51.28 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  40.48 
 
 		 248 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  40.38 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  42.22 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  40.82 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  38.3 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  47.73 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  43.4 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  43.9 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  51.28 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  44.19 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  51.28 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  38.18 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  51.28 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  51.28 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  51.28 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  51.28 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  51.28 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  44 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  39.53 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  43.9 
 
 		 75 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  41.3 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  38.1 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  42 
 
 		 64 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  51.28 
 
 		 80 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  51.28 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  51.28 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  40.48 
 
 		 267 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>