105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4140 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  217  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  41.9 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  40.95 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  40.95 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  40.95 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  43.81 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  39.05 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  43.3 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  42.72 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  39.62 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  39.62 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  54.76 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  37.74 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  55.93 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  54.24 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  57.35 
 
 		 82 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  59.38 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  57.41 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  43.37 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  59.38 
 
 		 79 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  59.38 
 
 		 79 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  59.38 
 
 		 79 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  59.38 
 
 		 79 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  43.68 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  60.34 
 
 		 82 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  52.17 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  52.17 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  39.05 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  48.53 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  47.76 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  52.38 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  49.28 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  50.79 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  47.37 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  43.86 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  39.13 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  37.33 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  35.59 
 
 		 285 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  44 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  42 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  46.94 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  46.94 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  46.51 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  41.18 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  41.18 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  48.89 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  44 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  35.59 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  44 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  44.9 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  44 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  41.51 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  45.45 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  37.78 
 
 		 267 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  44.44 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  42 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  40 
 
 		 52 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  43.18 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  43.75 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  44.19 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  39.22 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  33.93 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  43.64 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  39.53 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  42.86 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  45.24 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  36 
 
 		 202 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  35.29 
 
 		 303 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  40 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  27.38 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  40 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  36.73 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  37.21 
 
 		 248 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  37.21 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  37.21 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  34 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.18 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  44.9 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  34 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  35.59 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  30.65 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  40.48 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  35.29 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  38.78 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  32.56 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  39.58 
 
 		 76 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  32.56 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  29.51 
 
 		 73 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  39.58 
 
 		 76 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  36.07 
 
 		 89 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  40.48 
 
 		 82 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  31.48 
 
 		 66 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  34 
 
 		 94 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  32.56 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  32.56 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>