157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0259 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  174  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  73.26 
 
 		 88 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  71.43 
 
 		 88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  51.95 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  56 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  64.58 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.28 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  58 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  53.7 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  45.45 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  53.57 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.45 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  51.56 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  57.14 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  47.95 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  43.14 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  54 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  53.12 
 
 		 81 aa  60.1  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  47.17 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  56.86 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  51.02 
 
 		 58 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  56.86 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  45.45 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  48.94 
 
 		 303 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  47.06 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  41.51 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  44.44 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  42.31 
 
 		 57 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  51.06 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  44.23 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  56 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  41.67 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  45.1 
 
 		 76 aa  52.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  48 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  48 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  42.31 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  50.98 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  49.12 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  49.12 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  49.06 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  52.08 
 
 		 73 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  44.9 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  48.98 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  49.06 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  45.45 
 
 		 61 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  45.45 
 
 		 61 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  52.08 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  51.06 
 
 		 52 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  51.79 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  44.9 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50 
 
 		 251 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  43.66 
 
 		 267 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  40.35 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  50.98 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  50.98 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  44.68 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  47.83 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  47.06 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  45.28 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  45.45 
 
 		 112 aa  48.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  45.28 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  41.51 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  38.33 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  44.23 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  36.54 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  45.28 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  45.28 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  40.82 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  44.9 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  41.18 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  36.73 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  43.14 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  40.91 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  39.22 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  43.4 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  42 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  47.06 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  42 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  42 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  43.14 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  43.4 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  45.24 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  47.62 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  41.67 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  40.82 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  47.62 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  43.14 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  40.43 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  43.4 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  40.43 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  38.89 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  47.06 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  47.06 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  37.7 
 
 		 285 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  29.58 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>