109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4347 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  189  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  50.56 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  50.56 
 
 
94 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  55.81 
 
 
202 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  48.24 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  46.91 
 
 
248 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.1 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.73 
 
 
250 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  55 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  53.23 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  51.92 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  48.15 
 
 
80 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  50 
 
 
58 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  47.17 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  50.6 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  49.12 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  46.67 
 
 
303 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  48.89 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  45.1 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  44.83 
 
 
62 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  46.55 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  52.08 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  40.98 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  34.38 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46 
 
 
221 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  46.15 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  29.85 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  32.71 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  29.85 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  43.75 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  44.23 
 
 
110 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 
78 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  29.51 
 
 
156 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  45.65 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  41.82 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  45.83 
 
 
110 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  45.83 
 
 
110 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  41.82 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  47.5 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  46.94 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  43.4 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  45.28 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  51.22 
 
 
52 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  37.21 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  37.5 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  58.82 
 
 
285 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  32.79 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  42.59 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  44.83 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  29.09 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  41.27 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  43.18 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  34.85 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  37.29 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  45.45 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  37.29 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  43.75 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  43.75 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  43.75 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  37.29 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  37.29 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  43.75 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  43.75 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  29.23 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  43.75 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  32 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  34 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  28.36 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  30.3 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  42.55 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  47.5 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  36.59 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  38.64 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  47.5 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  41.67 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  41.38 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  44.64 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  37.31 
 
 
68 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  41.46 
 
 
155 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  39.58 
 
 
66 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  34 
 
 
155 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  44.9 
 
 
76 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  34 
 
 
155 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  31.15 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  44.83 
 
 
70 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  39.02 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  38.3 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  43.18 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  43.18 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  43.18 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  40.91 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  38.3 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.226695 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>