65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3515 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  320  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  98.06 
 
 
155 aa  313  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  83.44 
 
 
158 aa  274  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  82.78 
 
 
169 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  79.47 
 
 
156 aa  258  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  80.13 
 
 
172 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  80.13 
 
 
171 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23480  hypothetical protein  81.05 
 
 
158 aa  258  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  80.79 
 
 
156 aa  258  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  78.71 
 
 
155 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  78.71 
 
 
155 aa  253  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  46.81 
 
 
158 aa  147  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  39.81 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  56.52 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  54.35 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  46.94 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  53.33 
 
 
67 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  48.89 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  48.94 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  48.94 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  47.83 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  47.73 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  52.27 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  52.27 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  52.27 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  52.27 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  52.27 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  45.83 
 
 
91 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  42.86 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  47.73 
 
 
87 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  45.65 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  45.45 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  50 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  42.55 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  47.73 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  45.45 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  47.73 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  46.51 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  45.45 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  48.94 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  45.45 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  33.33 
 
 
248 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  33.96 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.29 
 
 
250 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  37.5 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  36.07 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  35.85 
 
 
58 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  32.73 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  36.21 
 
 
69 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  35.29 
 
 
64 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  30.16 
 
 
95 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  34.62 
 
 
85 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  36.07 
 
 
100 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  30 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  32.69 
 
 
80 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>