101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4259 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  140  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  58.82 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  50.85 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  55.77 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  55.56 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  51.02 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  44.44 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  54.9 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  47.54 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  53.06 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  51.92 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  45.9 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  50.98 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  46 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  45.28 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  52.08 
 
 		 55 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  43.64 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  41.51 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  34.38 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  35.59 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  37.74 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  35.59 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  45.83 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  39.29 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.21 
 
 		 251 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.18 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  36.73 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  40.91 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.19 
 
 		 250 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  38.89 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  40.82 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  42.86 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  35.85 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  32.76 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  32.76 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  40.82 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  40.82 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  34.43 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  41.67 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  39.22 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  38 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  40.82 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  40.82 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06026  hypothetical protein  37.04 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  40.82 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3773  protein of unknown function DUF1289  47.62 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  39.62 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  30.51 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  36.73 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  38.18 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  34 
 
 		 58 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  35.29 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  37.29 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  43.5  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  38.89 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  39.62 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  30.51 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  36.73 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  27.12 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  37.29 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  36.21 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  36.21 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  35 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  29.09 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 		 267 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  37.29 
 
 		 156 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  29.63 
 
 		 57 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  40.38 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  36.07 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  36.17 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  44.12 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  33.87 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  29.82 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  32.65 
 
 		 52 aa  40.8  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  32.69 
 
 		 303 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  35 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  35 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  37.5 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  38.3 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  32.65 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  31.48 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  36.54 
 
 		 248 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  32.14 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  35.59 
 
 		 77 aa  40  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  35.59 
 
 		 77 aa  40  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  34.62 
 
 		 147 aa  40  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  37.04 
 
 		 77 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  34.62 
 
 		 147 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>