111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1599 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  58.62 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  58.62 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  58.62 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  58.62 
 
 		 76 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  53.03 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  55.74 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  53.03 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  51.52 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  56.86 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  44.62 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  47.46 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  41.82 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  46 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  43.4 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  46 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  46.15 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  41.51 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  44.44 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  43.4 
 
 		 74 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  44.23 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0270  hypothetical protein  42.62 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  38.89 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  38.78 
 
 		 74 aa  50.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  41.82 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  41.38 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  39.58 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  38.98 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  40.74 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  39.13 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  43.48 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  39.13 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  36.73 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  43.48 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  43.48 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  43.48 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  43.48 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  38.89 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  44.23 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  38.89 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  41.38 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  41.3 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  52.63 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  41.38 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  41.3 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  41.3 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  41.67 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  39.22 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  42.31 
 
 		 285 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  43.48 
 
 		 267 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  36.84 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  31.58 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  37.7 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  41.51 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  37.93 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  37.74 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  36 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  41.3 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  37.04 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  36 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  42 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  39.58 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  37.78 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  38.6 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  36.73 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  36.73 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  41.86 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  37.78 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  39.66 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  34.04 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  35.09 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  43.14 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  38.6 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  37.29 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  38.18 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  39.13 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  34.04 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  42.59 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  34.04 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  42.59 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  34.04 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  43.14 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  43.48 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  38 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  34.69 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  32.79 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  40.82 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  37.04 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  31.58 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  45.83 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  34 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  37.29 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  37.29 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  40.82 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  35.42 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>