98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3162 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  84.42 
 
 		 82 aa  140  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  56.96 
 
 		 81 aa  98.2  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  58.44 
 
 		 76 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  57.33 
 
 		 83 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  54.79 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  53.52 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  53.52 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  53.52 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  53.52 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  53.42 
 
 		 77 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  53.42 
 
 		 77 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  54.17 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  50.68 
 
 		 77 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  47.95 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  47.3 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  44.12 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  45.28 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  30.16 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  36.54 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  40.74 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  36.54 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  38.89 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  33.9 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  42.31 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  42.59 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  40.38 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.17 
 
 		 250 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  44.23 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  43.4 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  43.14 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  51.43 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  40.82 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  41.3 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  31.75 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  39.62 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  44 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  36.54 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  31.67 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  41.67 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  45.45 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  48.57 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  39.62 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  32.14 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  37.04 
 
 		 303 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  48.57 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  36 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  30 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  39.62 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  39.62 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  35.29 
 
 		 55 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  41.51 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  39.13 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  35.19 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  35.19 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  40.82 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  36 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  39.62 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  40.82 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  30 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  34.55 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  29.55 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  29.55 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  51.52 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  43.4 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  51.52 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  29.55 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  41.51 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  40.91 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  39.62 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0270  hypothetical protein  45.71 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  38.78 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  36.54 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  35.42 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  39.62 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  33.96 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  36 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  28.12 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  39.53 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  39.53 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  39.53 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  38.64 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  40.82 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  39.53 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  31.37 
 
 		 267 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  35.85 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  38.64 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  32.73 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  39.13 
 
 		 143 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>