114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0317 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  144  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  53.85 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  53.85 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  53.85 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  53.85 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  50.91 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  47.46 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  52.63 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  52.63 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  51.06 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  54.05 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  54.05 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  44.07 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  48.94 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  48.94 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  58.97 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  48.94 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  41.38 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  48.94 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  53.33 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  53.33 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  53.33 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  53.33 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  46 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  43.75 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  43.14 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  37.29 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  54.05 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  44 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  38.18 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  51.35 
 
 		 285 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  38.18 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  42 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  42 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  42 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  41.82 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  44.68 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  37.5 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  42 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  28.57 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  37.04 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  38.89 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  41.3 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  44.23 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  37.74 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  41.3 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  36 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  34.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  38.3 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.74 
 
 		 250 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  38.3 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  45.83 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  45.83 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  45.83 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  38.3 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  45.83 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  38.3 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  33.93 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  37.04 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  37.04 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  45.83 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  37.04 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  37.04 
 
 		 102 aa  44.3  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  47.73 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  35.59 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  38.89 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  39.13 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  35.42 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  45 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  37.04 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  40.43 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  36.84 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  39.22 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  44.19 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  36 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  36.84 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  37.04 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0270  hypothetical protein  47.37 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  36.17 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  37.04 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  39.22 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  39.02 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  42 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  35.19 
 
 		 102 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  35.19 
 
 		 102 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  41.46 
 
 		 87 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  34.69 
 
 		 78 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  43.14 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  42.5 
 
 		 248 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  34.04 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  37.25 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3773  protein of unknown function DUF1289  45 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>