76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2792 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  148  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  78.12 
 
 		 68 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  78.12 
 
 		 68 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  75 
 
 		 71 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  60.87 
 
 		 70 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  62.12 
 
 		 76 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  62.12 
 
 		 76 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  62.12 
 
 		 76 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  60.61 
 
 		 76 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  51.52 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  51.02 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  51.02 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  51.02 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  45.1 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  51.02 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  44.64 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  48.98 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  52.63 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  61.36 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  46.94 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  46.94 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  46.94 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  42.37 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  39.29 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  40.35 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  44.9 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  38.33 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  40.82 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  38 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  33.9 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  38.6 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  43.48 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  43.48 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  43.48 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  34.62 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  38.46 
 
 		 60 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  36.36 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  42.59 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  46.15 
 
 		 267 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  39.58 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  39.58 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  48.72 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  35.71 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  37.93 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  42.86 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0270  hypothetical protein  58.06 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  32.73 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  34.62 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  35.85 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  47.37 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  40 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  39.29 
 
 		 65 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  41.67 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  31.03 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3157  hypothetical protein  38.33 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982589  normal  0.105283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  30.65 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  28.07 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  43.24 
 
 		 285 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  28.07 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  35.19 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  40.43 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2864  hypothetical protein  35.59 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  40.82 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  46.51 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  46.51 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  28.57 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  36.54 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  28.57 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  35.09 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  36.54 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 		 221 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  31.48 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>