30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2864 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2864  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3157  hypothetical protein  84.13 
 
 		 63 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982589  normal  0.105283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2107  hypothetical protein  95.24 
 
 		 66 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3626  hypothetical protein  93.65 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2290  hypothetical protein  89.39 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2468  hypothetical protein  71.67 
 
 		 60 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.835928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2233  hypothetical protein  69.49 
 
 		 60 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256275  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5160  hypothetical protein  68.42 
 
 		 57 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  34.04 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  34.04 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  34.04 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  39.29 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  32.65 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  33.33 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  33.33 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.74 
 
 		 250 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  36 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  37.74 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  36 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  35.59 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  37.21 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  32.76 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  32.14 
 
 		 248 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  32.76 
 
 		 72 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  35.71 
 
 		 303 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  35.85 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  31.67 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  30.36 
 
 		 73 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  35.19 
 
 		 70 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>