31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5160 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5160  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2233  hypothetical protein  80.7 
 
 		 60 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256275  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2468  hypothetical protein  78.95 
 
 		 60 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.835928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2864  hypothetical protein  68.42 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3157  hypothetical protein  67.27 
 
 		 63 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982589  normal  0.105283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2290  hypothetical protein  69.23 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3626  hypothetical protein  69.23 
 
 		 66 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2107  hypothetical protein  67.31 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  44.44 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  44.44 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  44 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  44 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  38.18 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  38.18 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  36.54 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  35.29 
 
 		 60 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  37.25 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  46.43 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  37.25 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  38 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  36.21 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  38 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  32.73 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  37.74 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  37.78 
 
 		 64 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  38.6 
 
 		 248 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  35.29 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  35.19 
 
 		 59 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  32.2 
 
 		 61 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>