86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  100 
 
 		 70 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  95.71 
 
 		 75 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  63.79 
 
 		 60 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  59.65 
 
 		 63 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  50.88 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  49.12 
 
 		 63 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  47.06 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  45.76 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2233  hypothetical protein  38.18 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256275  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5160  hypothetical protein  38.18 
 
 		 57 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  43.1 
 
 		 248 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2468  hypothetical protein  36.36 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.835928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  46.81 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2864  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.5 
 
 		 251 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  41.67 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982589  normal  0.105283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  43.75 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  41.27 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  43.75 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  38.98 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  38.98 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  42.55 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  47.92 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  43.4 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  43.4 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  47.62 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  38.71 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  39.34 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  46.94 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2107  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  41.51 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  48.84 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  47.73 
 
 		 52 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  44.44 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3626  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  44.19 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  37.74 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2290  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  42.86 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  42.86 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  42.86 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  35.71 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  36.36 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  45.65 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  48 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  47.62 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  47.62 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  44.68 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.33 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  47.62 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  48.89 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  45.45 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  59.38 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  38.33 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  47.62 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  42.22 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  43.86 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  42.22 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  44.9 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  37.04 
 
 		 76 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  42.55 
 
 		 74 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  45.83 
 
 		 78 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  42.55 
 
 		 74 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  39.29 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  41.46 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  35.19 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  44.44 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  41.86 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  38.78 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  42.55 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  42 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06026  hypothetical protein  54.84 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  36.67 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  42.55 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  43.48 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  35.59 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  37.5 
 
 		 73 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  41.54 
 
 		 86 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 		 70 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>