110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0908 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  140  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  97.14 
 
 		 70 aa  137  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  81.16 
 
 		 70 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  77.19 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  68.97 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3773  protein of unknown function DUF1289  62.5 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  57.14 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  54 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  47.54 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.7 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  52.94 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  52.08 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  55.32 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  47.92 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  48.08 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  52.08 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  52.08 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  47.17 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  48.15 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  46.15 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  51.06 
 
 		 52 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  48.08 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  52.08 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  51.06 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  41.27 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  45.83 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  46.15 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  51.72 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  48 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  48 
 
 		 62 aa  50.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.9 
 
 		 250 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  47.27 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  46.15 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  48.94 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  45.83 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  46.81 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  44.68 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  46 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  43.14 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  41.51 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  37.74 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  41.07 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  46 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  45.1 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  45.1 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  48.98 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  37.74 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  44 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  37.04 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  46.81 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  46 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  48.94 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  41.38 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  46 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  39.66 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  46 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  43.75 
 
 		 248 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  39.66 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  46.81 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  38.3 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  41.18 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  39.66 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  36.17 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  46.81 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  39.29 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  43.14 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  34.48 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  38.33 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  41.38 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  44 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  44 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  44 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  44 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  44 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  40.35 
 
 		 72 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  37.25 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  38 
 
 		 61 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06026  hypothetical protein  40.38 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  41.07 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  39.53 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  40 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  35.09 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  30.36 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  38.78 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  31.67 
 
 		 79 aa  41.2  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  42 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  41.18 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  42 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>