38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06026 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06026  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  44.64 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  40.74 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  61.76 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  37.74 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  40.38 
 
 		 61 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  41.18 
 
 		 57 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  44.68 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  36.36 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  36.36 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  36.54 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  34.55 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  37.04 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  48.48 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.85 
 
 		 251 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  34 
 
 		 303 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  42.55 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  35.85 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  35.85 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  42.55 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  35.85 
 
 		 52 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  42.55 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  33.96 
 
 		 73 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  42.55 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  40.38 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  36.54 
 
 		 70 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  36.21 
 
 		 100 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  34.48 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  42.55 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  40.38 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  42.55 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  42.55 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  41.18 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  54.84 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  38.3 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  32.69 
 
 		 248 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.85 
 
 		 250 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>