86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2528 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  78.12 
 
 
68 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06026  hypothetical protein  40.74 
 
 
59 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  42.03 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  52.94 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  51.06 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  40.98 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  44.07 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  40.85 
 
 
74 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  41.07 
 
 
61 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  38.24 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  46.55 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  40.98 
 
 
61 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  40.98 
 
 
61 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  48 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  44.23 
 
 
73 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.08 
 
 
251 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  57.45 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  57.45 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  42.86 
 
 
76 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  57.45 
 
 
52 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  45.65 
 
 
57 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  47.73 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  41.18 
 
 
61 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  40 
 
 
57 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  39.34 
 
 
61 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  46 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  47.83 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  53.19 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  42.31 
 
 
73 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  46.81 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  45.83 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  53.06 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  43.48 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  55.32 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  38 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  58.06 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  64.29 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  37.93 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  41.27 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  41.18 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  44.68 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  41.18 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  37.25 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  44.44 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  44.44 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  44.44 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  39.62 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  39.22 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  42.62 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  37.5 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  41.18 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  38 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  39.22 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.65 
 
 
221 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  46.15 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  34.92 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  51.06 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  51.06 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  43.14 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  43.64 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  39.22 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  37.04 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  44.68 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3157  hypothetical protein  33.96 
 
 
63 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982589  normal  0.105283 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  43.75 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  35.71 
 
 
82 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  37.21 
 
 
65 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2864  hypothetical protein  32.76 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  36.96 
 
 
303 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  42.55 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  37.5 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  34.69 
 
 
58 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  40.82 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  34.78 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2233  hypothetical protein  41.67 
 
 
60 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256275  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  42.11 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2468  hypothetical protein  41.67 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.835928  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  60.71 
 
 
248 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  39.62 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  36.96 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>