105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3916 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  80.88 
 
 		 144 aa  229  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  70.15 
 
 		 154 aa  199  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  70.23 
 
 		 147 aa  193  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  66.67 
 
 		 143 aa  192  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  67.16 
 
 		 159 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  65.15 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  63.7 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  66.42 
 
 		 146 aa  175  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  67.41 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  67.41 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  59.26 
 
 		 80 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  45.33 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  55.36 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  57.41 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  57.41 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  57.41 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  57.41 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  48.39 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  57.41 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  55.36 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  55.56 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  48.39 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  55.56 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  51.85 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  46.67 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  45.1 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  45.1 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  45.1 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  38.96 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  38.96 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  41.18 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  53.06 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  39.22 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  39.22 
 
 		 171 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3056  hypothetical protein  41.79 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  38.98 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  45.65 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  45.65 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  40.82 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23480  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  46.15 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  39.22 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7555  hypothetical protein  30.77 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0181616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  43.59 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.98 
 
 		 250 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  33.96 
 
 		 248 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0009  hypothetical protein  37.31 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3357  hypothetical protein  39.71 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3923  hypothetical protein  37.31 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  43.59 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  37.78 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  32 
 
 		 58 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  36.36 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  47.5 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5001  hypothetical protein  37.68 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575003  normal  0.194568 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  36.17 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  32.2 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7333  hypothetical protein  35.29 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0363083  hitchhiker  0.00913709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2925  hypothetical protein  34.33 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3257  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4003  hypothetical protein  34.33 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  35.19 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  47.5 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  42.5 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  36.36 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  42.5 
 
 		 68 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2979  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0076  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3385  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1618  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4077  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0182357  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2984  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  32 
 
 		 79 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0076  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0094  hypothetical protein  41.67 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  35.42 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  40.48 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  38.64 
 
 		 303 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0067  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  44.12 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0075  hypothetical protein  41.67 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  40.35 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  40.35 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3551  hypothetical protein  35.29 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  39.06 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  39.47 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>