181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0112 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  100 
 
 		 88 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  89.77 
 
 		 88 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  71.43 
 
 		 88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  55.93 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  58.06 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.84 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  48.53 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  60 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.83 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  54.17 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  56.9 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  47.62 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  51.79 
 
 		 248 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  50.79 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  53.85 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  55.1 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  53.85 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  53.06 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  46.03 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  53.06 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  54.17 
 
 		 55 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  53.06 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  48.98 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  37.88 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  51.06 
 
 		 303 aa  57.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  41.67 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  48.08 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  51.11 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  54.76 
 
 		 57 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  46 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  52.08 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  48.98 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  51.92 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  52.08 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  46.94 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  49.12 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  48.15 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  51.02 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  48.21 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  49.02 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  43.1 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  46 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  44.23 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  48.08 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  46.94 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  44.9 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  39.47 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  39.47 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  59.09 
 
 		 267 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  52.08 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  48.08 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  42.31 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  46.55 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  44 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  51.02 
 
 		 285 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  44.44 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  48 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  46.15 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  39.62 
 
 		 74 aa  50.1  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  46.94 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.94 
 
 		 251 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  44.9 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  38.78 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  43.4 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  44.68 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  48.08 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  42.55 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  48.08 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  47.83 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  38.89 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  36.84 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  36.84 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  37.25 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  46.94 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  44.44 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  44.44 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  44.44 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  44.44 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  44.9 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  44.9 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  44.23 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  45.45 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  38.3 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  38.78 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  35.29 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  45.65 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  42.55 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  42.86 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  46.94 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  44.9 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>