128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1974 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  137  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  77.19 
 
 
70 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  77.19 
 
 
70 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  75.44 
 
 
70 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  70.91 
 
 
70 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3773  protein of unknown function DUF1289  70.45 
 
 
71 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  49.18 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  52.83 
 
 
64 aa  61.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  48.21 
 
 
73 aa  60.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  56 
 
 
55 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  53.57 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  52.63 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  50.94 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  56 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  57.69 
 
 
82 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  57.45 
 
 
52 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.98 
 
 
250 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  52.46 
 
 
68 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  51.92 
 
 
72 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  50.98 
 
 
72 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  57.45 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  57.45 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  52 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  48.21 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  51.02 
 
 
74 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  51.06 
 
 
78 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  49.09 
 
 
76 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  55.32 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  52 
 
 
70 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  52 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  52 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  54.76 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  41.51 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  51.06 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  46.15 
 
 
61 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  52.08 
 
 
88 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  50.98 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  47.54 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  47.27 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  47.27 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  40.43 
 
 
57 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  47.27 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  42.19 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  42.59 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  47.27 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  48 
 
 
62 aa  50.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  43.4 
 
 
248 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  43.4 
 
 
64 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  47.46 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  46 
 
 
79 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  45.16 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  42.86 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.02 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  48.94 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  50.94 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  44.68 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  42.86 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  42.86 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  39.58 
 
 
57 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  42.86 
 
 
60 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  47.92 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  41.67 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  48.84 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  36.36 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  48.84 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  42.55 
 
 
58 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  39.29 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  41.67 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  38.71 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  46.81 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  43.1 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  43.1 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  44.44 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  43.1 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  41.46 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  43.1 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  43.1 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  39.58 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  42.37 
 
 
103 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  40 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  40 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  33.87 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  41.07 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  41.38 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  41.38 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  41.07 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  41.07 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  42.62 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  34.55 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  42.37 
 
 
103 aa  42.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  36.84 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  36.51 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  40.48 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  32.73 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  43.33 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  36.21 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>