114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0084 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  56.6 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  64 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  55.1 
 
 		 248 aa  63.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  55.77 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  56 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  56 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  54 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  47.17 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  48.08 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  46.15 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  66.67 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  54 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  55.1 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  49.02 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  51.02 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  55.1 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  47.92 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  51.02 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.9 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  48.98 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  46.94 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  44.23 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.9 
 
 		 250 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.92 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  44.68 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  40.74 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  46.94 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  41.27 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  42.31 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  41.18 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  57.14 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  38.6 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  38.46 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  34.62 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  43.14 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  42.55 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  37.74 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  43.75 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  38.89 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  37.74 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  40.58 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  32.69 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  40.82 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  44.68 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  37.74 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  40.82 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  44 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  40.98 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  37.21 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  38.78 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  40.43 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  42 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  39.34 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  44.44 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  42.31 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  46.51 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  37.25 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  35.29 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  42.31 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  43.14 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  42.59 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  44.19 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  40.82 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  39.68 
 
 		 285 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  44.19 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  37.74 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  43.14 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  43.14 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  38.3 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  42.31 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  42.59 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  42.59 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  40.91 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  43.14 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  43.14 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  42.59 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  40.74 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  43.14 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  35.85 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  40.91 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  39.13 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  45.1 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  40.91 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  35.59 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  44.19 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  41.86 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  41.86 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  40.91 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  34 
 
 		 65 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  40.74 
 
 		 103 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  38.64 
 
 		 79 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  40.74 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>