122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2838 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  300  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  77.1 
 
 
154 aa  214  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  72.34 
 
 
144 aa  213  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  71.43 
 
 
143 aa  204  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  71.76 
 
 
159 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  70.23 
 
 
136 aa  193  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  68.7 
 
 
147 aa  186  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  70.29 
 
 
146 aa  180  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  64.12 
 
 
156 aa  169  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  66.17 
 
 
147 aa  167  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  66.17 
 
 
147 aa  167  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  57.14 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  39.74 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  58.18 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  58.18 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  58.18 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  58.18 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  58.18 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  58.18 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  58.18 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  56.36 
 
 
80 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  43.28 
 
 
87 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  54.55 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  54.55 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  54.55 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  54.55 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  54.55 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  54.55 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  52.73 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  54.55 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  50.88 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  50.91 
 
 
67 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  47.62 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  42.11 
 
 
86 aa  59.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  42.11 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3357  hypothetical protein  44.29 
 
 
75 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  44.9 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  42.86 
 
 
172 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0009  hypothetical protein  41.79 
 
 
74 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  42.86 
 
 
171 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  42.86 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  42.86 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  42.86 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  36.51 
 
 
248 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  44.07 
 
 
70 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3923  hypothetical protein  41.79 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  37.29 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3551  hypothetical protein  41.43 
 
 
88 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7333  hypothetical protein  38.57 
 
 
70 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0363083  hitchhiker  0.00913709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3227  hypothetical protein  41.43 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3056  hypothetical protein  40.3 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  45.45 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7555  hypothetical protein  34.33 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0181616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  36.84 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  45.24 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.28 
 
 
250 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2925  hypothetical protein  38.81 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  45.45 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4003  hypothetical protein  38.81 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  45.45 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3257  hypothetical protein  37.31 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3385  hypothetical protein  38.81 
 
 
76 aa  47.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1618  hypothetical protein  38.81 
 
 
76 aa  47.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4077  hypothetical protein  38.81 
 
 
76 aa  47.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0182357  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2984  hypothetical protein  38.81 
 
 
76 aa  47.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0094  hypothetical protein  37.31 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.628035 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2979  hypothetical protein  37.31 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0076  hypothetical protein  37.31 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961421  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0075  hypothetical protein  37.31 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639778  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23480  hypothetical protein  47.73 
 
 
158 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  36.76 
 
 
95 aa  47.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0076  hypothetical protein  37.31 
 
 
86 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  40.82 
 
 
155 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6513  hypothetical protein  48.89 
 
 
83 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521299  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5602  hypothetical protein  47.83 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0067  hypothetical protein  37.31 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727521  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  36.36 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  37.25 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  30.77 
 
 
70 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  37.5 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  38.78 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  37.21 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  32.08 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  37.88 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  34 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  47.37 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  36.59 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  38.64 
 
 
202 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  35.29 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  40.91 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.7 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  34.72 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  46.67 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  36.59 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  37.5 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  36.36 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  40.91 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>