176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1551 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  53.12 
 
 
73 aa  77  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  63.64 
 
 
64 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  60 
 
 
76 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  55.56 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  45.61 
 
 
57 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  55.56 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  61.22 
 
 
64 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  49.18 
 
 
70 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  51.85 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  52.94 
 
 
72 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  56 
 
 
72 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  53.7 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  50.91 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  50.94 
 
 
79 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  44.07 
 
 
61 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  55.1 
 
 
78 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  42.11 
 
 
61 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.21 
 
 
250 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  47.83 
 
 
112 aa  57  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  41.82 
 
 
57 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  49.02 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  40.35 
 
 
61 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  40.35 
 
 
61 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  42.11 
 
 
61 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  49.02 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  44.62 
 
 
73 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  45.45 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  54.17 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  44.07 
 
 
72 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  46.3 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  38.98 
 
 
61 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  48.15 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  51.02 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  52.94 
 
 
55 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  52.08 
 
 
70 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  43.55 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  55.81 
 
 
76 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  45.28 
 
 
78 aa  52.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  55.81 
 
 
76 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  46.94 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  51.06 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  46.94 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  55.56 
 
 
88 aa  52  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  44.44 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  45.24 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06026  hypothetical protein  37.74 
 
 
59 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  40 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  44.9 
 
 
52 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  44.64 
 
 
68 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  44.64 
 
 
68 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  48.98 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  48.94 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  43.86 
 
 
248 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  49.06 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  44.9 
 
 
60 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  46.15 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  43.14 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  43.14 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  44 
 
 
58 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  43.9 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  42.31 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  42.31 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  42.31 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  43.9 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  45.24 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  40.91 
 
 
285 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  44.64 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  42.86 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  40.48 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  36.36 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  44 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  48.94 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  42.86 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  42.22 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  38.78 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  46.94 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  46.67 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3157  hypothetical protein  40 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982589  normal  0.105283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  37.68 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  40.43 
 
 
62 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  37.68 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  36.36 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.98 
 
 
221 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  38.46 
 
 
77 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  40.48 
 
 
159 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  41.18 
 
 
88 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.74 
 
 
251 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  43.64 
 
 
86 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  44.9 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  44.9 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  39.22 
 
 
66 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  35.59 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  36.23 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  44.9 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  37.84 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>