101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4029 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  298  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  99.32 
 
 
147 aa  295  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  71.72 
 
 
146 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  67.13 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  67.41 
 
 
136 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  66.42 
 
 
154 aa  189  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  66.17 
 
 
147 aa  183  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  65.15 
 
 
147 aa  180  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  63.01 
 
 
159 aa  180  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  62.96 
 
 
144 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  62.96 
 
 
156 aa  176  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  65.45 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  65.45 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  65.45 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  65.45 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  65.45 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  65.45 
 
 
80 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  63.64 
 
 
67 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  52 
 
 
79 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  61.82 
 
 
67 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  61.82 
 
 
67 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  61.82 
 
 
67 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  61.82 
 
 
67 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  61.82 
 
 
67 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  61.82 
 
 
67 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  61.82 
 
 
67 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  61.82 
 
 
80 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  60 
 
 
67 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  58.18 
 
 
67 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  60 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  46.27 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  56.36 
 
 
67 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  46.27 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  42.35 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  42.35 
 
 
86 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  50.82 
 
 
91 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  46.94 
 
 
169 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3357  hypothetical protein  42.86 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  46.81 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  41.18 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  47.73 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  42.86 
 
 
172 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  47.73 
 
 
171 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  47.73 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  47.73 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23480  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  37.14 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0009  hypothetical protein  38.81 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  42.86 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7555  hypothetical protein  38.1 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0181616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3551  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  47.73 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3923  hypothetical protein  40.62 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3227  hypothetical protein  40.91 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6513  hypothetical protein  46.94 
 
 
83 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521299  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3056  hypothetical protein  40.62 
 
 
85 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  35.19 
 
 
248 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  34 
 
 
58 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  36.73 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  37.5 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.62 
 
 
251 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5602  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  43.75 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  37.78 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7333  hypothetical protein  33.82 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0363083  hitchhiker  0.00913709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  39.02 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3257  hypothetical protein  46.81 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.7 
 
 
250 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  37.5 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  36.17 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2979  hypothetical protein  46.81 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0067  hypothetical protein  46.81 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727521  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0076  hypothetical protein  46.81 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  34 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  36.36 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0076  hypothetical protein  46.81 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0094  hypothetical protein  46.81 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.628035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0075  hypothetical protein  46.81 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639778  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  30.51 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2925  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  38.64 
 
 
74 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4003  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  36.59 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  40.54 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3385  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1618  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4077  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0182357  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2984  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  41.3 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  34.38 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  44.44 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  32.81 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  35 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  39.53 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  40  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  35.71 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  34.62 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5001  hypothetical protein  43.18 
 
 
69 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575003  normal  0.194568 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>