84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2035 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  56.86 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  43.86 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  43.86 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  43.86 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  51.06 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  61.36 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  43.86 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  44.83 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  46.81 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  48.94 
 
 		 56 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  47.83 
 
 		 68 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  61.11 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  47.83 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  54.76 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  45.83 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  42.59 
 
 		 70 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  46 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  41.67 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  35.71 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  41.67 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  41.67 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  42.55 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  46.34 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  38.3 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  46.94 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  42.11 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  48.98 
 
 		 285 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  38.98 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  43.9 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  31.75 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  41.07 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  43.9 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  42.55 
 
 		 79 aa  47.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  38.71 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  43.9 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  47.5 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0270  hypothetical protein  71.43 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  43.9 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  42.55 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  38.3 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  44.68 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  37.5 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  37.5 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  45.83 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  37.5 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  45 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  44.68 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  45 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  37.5 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  42 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  46.81 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  45 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  45 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  41.67 
 
 		 267 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  46.81 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  48.94 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  42.55 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  38.78 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  35.42 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  39.58 
 
 		 55 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  46.81 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  46.81 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  30.91 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.58 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  40.38 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  37.5 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  34.62 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  42.55 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  44.9 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  43.75 
 
 		 76 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0775  hypothetical protein  37.21 
 
 		 102 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.385738  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  39.58 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  43.48 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  40.43 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  46.15 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  40.43 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  34.48 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3773  protein of unknown function DUF1289  41.46 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  37.5 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>