62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2574 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  91.04 
 
 		 68 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  88.06 
 
 		 68 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  75 
 
 		 71 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  61.76 
 
 		 76 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  61.76 
 
 		 76 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  61.76 
 
 		 76 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  60.29 
 
 		 76 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  57.58 
 
 		 70 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  55.74 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  38.1 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  43.33 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  43.33 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  43.33 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  43.33 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  52.63 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  39.68 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  41.67 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  41.67 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  41.67 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  33.87 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  44.83 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  36.51 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  30.16 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  36.92 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  30.16 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  38.98 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  62.5 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  41.86 
 
 		 285 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  36.73 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  32.79 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  32.31 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  36.84 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  38.81 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  38.6 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0270  hypothetical protein  63.33 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  43.14 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  41.18 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  47.37 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  48.57 
 
 		 267 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  32.79 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  47.37 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  47.37 
 
 		 72 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  38.78 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  36.51 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  42 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  38.64 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  38.64 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  38.64 
 
 		 74 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  38.64 
 
 		 74 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  39.22 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  32.76 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  35.29 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  35.19 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  44.44 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>