68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1548 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  100 
 
 		 77 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  80.26 
 
 		 77 aa  129  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  80.26 
 
 		 77 aa  129  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  78.95 
 
 		 77 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  77.63 
 
 		 77 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  75 
 
 		 77 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  63.89 
 
 		 74 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  67.61 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  61.04 
 
 		 81 aa  98.6  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  61.64 
 
 		 75 aa  97.1  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  63.38 
 
 		 76 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  53.52 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  45.21 
 
 		 82 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  51.02 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  50.98 
 
 		 68 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  50.98 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  43.33 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  53.33 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  43.75 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  45.83 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  38.78 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  43.48 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  46.3 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  40 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  33.96 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  40.38 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  39.02 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  42.55 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  42.55 
 
 		 285 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  38 
 
 		 267 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  39.22 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  40.82 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  34 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  34.62 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  34.09 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  34.09 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  41.67 
 
 		 55 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  37.88 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  34.09 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  45.65 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05426  hypothetical protein  48.89 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  39.29 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  38.46 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  38.3 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  41.3 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  39.29 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  39.29 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  35.19 
 
 		 88 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.82 
 
 		 221 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  42.86 
 
 		 78 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  36.17 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  32.69 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  34.04 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  40.43 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  43.9 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  38.89 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  38.46 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  38.89 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  38.89 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  31.94 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>